Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF3O75054 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms