Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD4O60885 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD4O60885 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD4O60885 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD4O60885 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD4O60885 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD4O60885 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD4O60885 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms