Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPLO60437 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPLO60437 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPLO60437 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPLO60437 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPLO60437 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPLO60437 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPLO60437 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPLO60437 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms