Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1BO43795 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1BO43795 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms