Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH3O43739 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYTH3O43739 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms