Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms