Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRODHO43272 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms