Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms