Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD8O14715 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD8O14715 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms