Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE40O14503 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms