Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVH48-1M5A8F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms