Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms