Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QR89 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QR89 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QR89 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3QR89 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3QR89 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3QR89 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms