Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms