Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BL2E5RIL1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms