Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf172C9J069 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf172C9J069 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf172C9J069 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf172C9J069 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf172C9J069 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms