Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms