Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF879B4DU55 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms