Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BECN2A8MW95 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms