Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEURL1BA8MQ27 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEURL1BA8MQ27 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms