Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms