Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC37A2A6NM11 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC37A2A6NM11 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms