Protein–RNA interactions for Protein: A6NGD5

ZSCAN5C, Putative zinc finger and SCAN domain-containing protein 5C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN5CA6NGD5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZSCAN5CA6NGD5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZSCAN5CA6NGD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZSCAN5CA6NGD5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZSCAN5CA6NGD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZSCAN5CA6NGD5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZSCAN5CA6NGD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms