Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM149AA5PLN7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM149AA5PLN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM149AA5PLN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms