Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms