Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE3A1L190 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms