Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PQD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PQD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms