Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV1-27A0A075B6S5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms