Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP002469.1-201ENST00000526011 1043 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC244090.2-201ENST00000567614 792 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SL246P-201ENST00000584467 296 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC007161.2-201ENST00000604734 1109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC002059.1-201ENST00000608014 477 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ADAL-208ENST00000610420 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01170-202ENST00000628324 650 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TAF1A-201ENST00000350027 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MFSD1P1-201ENST00000576210 1327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL031676.1-201ENST00000412519 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PACRG-203ENST00000366889 1503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IGLV6-57-201ENST00000390285 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ARHGEF7-IT1-201ENST00000423329 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02093-201ENST00000440522 485 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PSPC1P1-201ENST00000442352 665 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AF186996.8-201ENST00000463158 907 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DNAJC19-205ENST00000479269 610 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 TRIM2-207ENST00000482578 773 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FABP5P7-201ENST00000524732 405 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TP53TG3HP-201ENST00000563487 346 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01834-201ENST00000567374 385 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC090079.1-201ENST00000572092 1183 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AA06-201ENST00000579745 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC005379.1-201ENST00000585647 328 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LGALS17A-205ENST00000598736 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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