Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V9GYV3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V9GYV3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V9GYV3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V9GYV3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V9GYV3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V9GYV3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V9GYV3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms