Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
U3KQE9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
U3KQE9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
U3KQE9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
U3KQE9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms