Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL4A3BPQ9Y5P4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms