Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms