Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP58Q9Y2X3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms