Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms