Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF13BQ9Y275 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms