Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms