Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms