Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms