Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms