Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRQQ9UMZ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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