Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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