Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNPO2Q9UMS6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNPO2Q9UMS6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms