Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms