Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms