Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms