Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEFF2Q9UIK5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms