Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms