Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms