Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NXF1Q9UBU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NXF1Q9UBU9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms